Kladogram : pengertian, istilah penting, dan jenis jenis kladogram

     

Kladogram : istilah evolusi, pengertian, Istilah penting, jenis jenis dan model gambar. 

     Kladogram adalah sebuah diagram berupa pohon yang digunakan untuk menunjukkan hubungan kekerabatan antara spesies atau kelompok organisme. Kladogram dibuat berdasarkan data filogenetik, yaitu data yang berisi informasi mengenai perubahan-perubahan genetik pada organisme dari waktu ke waktu.

Istilah-istilah penting dalam kladogram antara lain:

  • Node: titik cabang di dalam pohon yang menunjukkan keberadaan nenek moyang terakhir dari semua organisme yang berada di bawahnya.
  • Clade: kelompok organisme yang terdiri dari nenek moyang bersama dan semua keturunannya.
  • Monophyletic: kelompok organisme yang membentuk sebuah clade, yaitu semua keturunan dari nenek moyang bersama.
  • Paraphyletic: kelompok organisme yang terdiri dari nenek moyang bersama dan beberapa, namun tidak semua, keturunannya.
  • Polyphyletic: kelompok organisme yang terdiri dari organisme yang tidak memiliki nenek moyang bersama.
  • Outgroup: organisme atau kelompok organisme yang memiliki hubungan kekerabatan yang paling jauh dengan kelompok organisme yang sedang dipelajari.
  • Taxon : adalah sebuah kelompok organisme atau spesies yang memiliki kesamaan dalam karakteristik tertentu. 




Jenis jenis kladogram adalah sebagai berikut : 

  • Phylogram: kladogram yang menunjukkan hubungan kekerabatan antara organisme dengan menggambarkan jarak evolusioner antara mereka. Jarak evolusioner biasanya diukur dengan menggunakan perbedaan urutan asam amino pada protein atau perbedaan urutan DNA.
  • Ultrametric: kladogram yang menunjukkan waktu cabang dengan cara menampilkan jarak waktu yang sama antara semua cabang.

  • Cladogram: kladogram yang menunjukkan hubungan kekerabatan antara organisme dengan cara menunjukkan hanya cabang yang terjadi di titik perpecahan spesies atau peristiwa divergensi.
  • Phenogram: kladogram yang menunjukkan hubungan kekerabatan antara organisme dengan cara menunjukkan kemiripan fenotipik (tampilan fisik) antara mereka. Kemiripan fenotipik biasanya diukur dengan menggunakan data morfologi atau anatomi organisme.
Kladogram adalah alat penting dalam studi filogenetik karena dapat membantu ilmuwan untuk memahami evolusi organisme dan hubungan kekerabatan antara mereka. Dalam melakukan analisis filogenetik, penting untuk memilih metode kladogram yang tepat dan menginterpretasi hasil kladogram dengan hati-hati untuk menghindari kesalahan dalam penafsiran data.

Sumber : 

Hillis, D. M., Moritz, C., & Mable, B. K. (Eds.). (1996). Molecular systematics (Vol. 2). Sinauer Associates.

Baum, D. A., Smith, S. D., & Donovan, S. S. (2005). The tree-thinking challenge. Science, 310(5750), 979-980.

Felsenstein, J. (1985). Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution, 39(4), 783-791.

Hennig, W. (1966). Phylogenetic systematics. Annual Review of Entomology, 11(1), 97-116.

Maddison, W. P., & Maddison, D. R. 

Komentar

Posting Komentar

Postingan populer dari blog ini

Regulasi Genetika pada Bakteri E. coli: Mekanisme Lac Operon dalam Mengontrol Metabolisme Laktosa

Gambar
Pengertian Lac Operon         Lac operon adalah suatu sistem genetika pada bakteri E. coli yang mengatur sintesis enzim-enzim yang terlibat dalam metabolisme laktosa. Pada E. coli, gen-gen yang mengode enzim-enzim tersebut terletak pada suatu fragmen DNA yang disebut operon. Terdapat tiga gen yang terdapat pada operon lac, yaitu gen lacZ, gen lacY, dan gen lacA. Gen lacZ mengode enzim β-galaktosidase, gen lacY mengode permease laktosa, dan gen lacA mengode transacetylase. Lalu bagaimana Mekanisme Lac Operon dalam meregulasi metabolisme laktosa?        Mekanisme lac operon saat terdapat glukosa dan laktosa secara bersamaan dapat dijelaskan sebagai berikut:      Glukosa Tersedia, Laktosa Tidak Tersedia Ketika glukosa tersedia, maka E. coli akan lebih memilih untuk menggunakan glukosa sebagai sumber energi daripada laktosa. Pada kondisi ini, konsentrasi cAMP (cyclic adenosine monophosphate) akan rendah karena tidak dibutuhkan unt...
Baca selengkapnya

Regulasi Siklus Sel: Tahap-Tahap Mitosis, Protein CDK dan Cyclin, dan Proses Cek Poin

Gambar
Bagaimana sel dapat mengganda dan bertambah banyak? Proses apa yang meregulasi proses tersebut?  Mitosis adalah proses pembelahan sel yang terjadi secara teratur dan bertanggung jawab untuk pertumbuhan dan pemeliharaan jaringan tubuh. Tahap mitosis terdiri dari interfase, G1, S, G2, dan M. Interfase merupakan tahap persiapan sebelum sel memasuki siklus mitosis sebenarnya Bagaimana proses Mitosis berlangsung?   Pada tahap G1 (Gap 1), sel mulai memperbesar ukuran dan mengekspresikan gen yang diperlukan untuk mempersiapkan replikasi DNA. Selanjutnya, pada tahap S (synthesis), DNA sel di-replikasi sehingga terbentuk dua salinan kromosom identik. Pada tahap G2 (Gap 2), sel mempersiapkan diri untuk pembelahan sel dengan mensintesis protein yang diperlukan untuk membentuk spindle, yang merupakan struktur penting untuk pemisahan kromosom selama pembelahan sel. Setelah G2, sel memasuki tahap M (mitosis) yang terdiri dari empat tahap yaitu profase, metafase, anafase, dan telofase. Pada ...
Baca selengkapnya